Llevo ya cumplido 1 año de contrato, ¿Puede el propietario poner 1 cláusula d renovación anual y pedirme que le avise con 3 meses antelación al salir?

Los contratos, salvo que sean de temporada (demostrable), realmente se están firmando por 5 años obligatoriamente para el arrendador y potestativamente para el arrendatario, es decir: no se prorrogan anualmente. Por lo tanto, no se pueden añadir clausulas hasta la caducidad del contrato. De todas formas si pactásteis 90 días de antelación, si podrá cobrarte el importe, pero no podrá aplicar penalización alguna si no se ha pactado previamente.